En 2013, Carlos se unió a la Juventus, donde recuperó su mejor forma y ganó el Scudetto en sus dos temporadas en Italia, además de volver a la final de la Champions League en 2015. Luego de su mejor año en Europa, el Apache regresó a Boca Juniors, ayudando a los xeneizes a obtener el Campeonato 2015 y la Copa Argentina.
